Folding@Home tím pretaktovanie.sk - 229. miesto, GPU3 klient na ceste

Pomaly ale isto sa náš Folding@home tím dostáva čoraz bližšie k hranici najvýkonnejšej dvestovke tímov na svete. Nový klient pre grafické karty je už na ceste, najvyšší čas aktualizovať ovládače.Je vždy potešením informovať o postupe tímu pretaktovanie.sk v projekte skúmania skladania proteínov - Folding@home. Tak je to aj tentoraz, keď sme sa dostali už na 229. miesto spomedzi všetkých tímov sveta, od poslednej aktualizácie začiatkom marca sme si teda polepšili o 28 miest smerom nahor!
Pozitívne je, že nový členovia pribúdajú do tímu v podstate stále, momentálne je nás 346 (z toho pravidelne aktívnych niečo okolo štyridsiatky).

Témou tejto aktuality však nie je iba report o vývoji pozície nášho tímu, ale predovšetkým nové informácie o dlho očakávanom GPU3 klientovi pre grafické karty.
Táto nová verzia klienta prinesie mnoho zlepšení, ako napríklad presnejšie simulačné modely, nové typy úloh, až dvojnásobne rýchlejšie spracovanie výpočtov, vyššiu stabilitu či neskôr aj multiplatformovú OpenCL funkcionalitu.

Ako sme avizovali už dávnejšie, GPU3 klient bude založený na novej knižnici OpenMM, nahradzujúcej jadro Gromacs. Tiež bude GPU3 vydaný najprv pre nVidia grafické karty, teda OpenMM s CUDA technológiou. Dôvod prečo nie zároveň aj pre ATi sme spomenuli v predchádzajúcom článku, nebudeme sa teda k tomu vracať.
Pre správne fungovanie nového klienta bude nutné spraviť dva kroky:

1. - aktualizovať CUDA ovládače aspoň na verziu 2.2.
2. - stiahnuť a spustiť nový GPU klient

Nový klient bude serverom hlásiť podporovanú verziu CUDA technológie, preto aby boli korektne pridelené úlohy na počítanie, je najlepšie aktualizovať ovládače na čo najnovšie. Akú verziu CUDA ovládačov máte nainštalovanú zistíte podľa čísla ovládačov grafickej karty:

CUDA 2.0: GeForce 177.35+
CUDA 2.1: GeForce 180.60+
CUDA 2.2: GeForce 185.85+
CUDA 2.3: GeForce 190.38+
CUDA 3.0/OpenCL: GeForce 195.36+

alebo v ovládacom paneli grafickej karty:


Konkrétny dátum vypustenia novej verzie GPU klienta je zatiaľ neznámy, práve majú prebiehať interné testovania. Dovtedy majiteľom nVidia grafických kariet s podporu CUDA (GeForce 8000 a novšie) odporúčam aktualizovať svoje ovládače.

Ohlásená bola tiež podpora GeForce GTX 400 kariet, v priebehu niekoľkých týždňov by mal byť vydaný nový klient s optimalizáciami pre nový hardvér. Prvé čísla výkonu sú údajne veľmi dobré.



Pre tých, ktorým je pojem Folding@Home novinkou, prinášam malé vysvetlenie aj s návodom na zapojenie sa do projektu. Ak budete chcieť, môžete sa pridať do nášho tímu pretaktovanie.sk s číslom 124205.


Folding@Home je projekt Stanfordskej univerzity, ktorý skúma spôsob skladania proteínov. Pochopenie a zmapovanie tohto deja napomôže výskumu liečby dnes nevyliečiteľných a zákerných chorôb ako Alzheimer, choroba šialených kráv (BSE), CJD, ALS, Huntington, Parkinson a mnohých druhov rakovín.


Skúmanie správania sa proteínov si však vyžaduje obrovský výpočtový výkon počítačov, taký obrovský, že aj najväčšie superpočítače sveta sú jednoducho "pomalé". Ako však získať ešte vyšší výkon? Odpoveďou je distribuované počítanie - úlohy sa podelia na veľmi malé časti, ktoré sa analyzujú na samostatných počítačoch a výsledky sa odošlú do centrálnej databázy. Vďaka tomuto systému sa tak k hľadaniu liečby chorôb môže zapojiť ktokoľvek - stačí si stiahnuť obslužnú aplikáciu (tzv. klient) a nechať sťahovať a počítať čiastkové úlohy.

Aby sa takéto prispievanie jednotlivých užívateľov zatraktívnilo, zaviedol sa celosvetový rebríček, ktorý združuje jednotlivcov alebo tímy. Tie potom "súťažia" o najvyššie dosiahnuté miesto - postupuje sa vďaka vypočítaným úlohám.

Tí, ktorí sa ešte do nášho tímu nezapojili a majú záujem, uvádzam krátky návod ako na to:

Najviac výkonu sa získa výpočtami na grafických kartách (počítať sa dá samozrejme aj na bežných procesoroch). Dnes sú podporované tie, ktoré majú unifikovanú architektúru - teda majú v jadre tzv. shader-y, alebo stream procesory. U ATi sú to karty od HD2000 vyššie, u nVidie od GeForce 8000 vyššie.

Najprv je nutné stiahnuť si aktuálnu verziu klienta:
- Download Folding@Home - ATi, nVidia
- Download Folding@Home - nVidia (špeciálny zobrazovač animácie pre nVidia karty)

Po stiahnutí si aplikáciu nainštalujte a keď sa dostanete na okno nastavení, zadajte nasledovné:


Dôležité je číslo tímu - 124205.

Po tomto kroku sa v tray lište pri hodinách zobrazí malá ikonka Folding@Home. Pri prvom spustení sa klient pokúsi stiahnuť úlohu, ktorú začne o chvíľu počítať na grafickej karte.


V tabuľke tímu sa vaše meno zobrazí až po určitom čase po odoslaní prvej vypočítanej úlohy. Aktuálny stav výpočtov zobrazíte ukázaním na ikonku, alebo pomocou softvéru FahMon.

Samotný klient poskytuje aj grafickú animáciu priebehu. Táto animácia je len ukážková, pre výpočty ju netreba mať zobrazenú a v skutočnosti uberá na výkone - ak ju teda nechcete sledovať, pokojne ju skryte:



Pre viac informácií o projekte, našom tíme a všetkých otázkach ohľadom Folding@Home zamierte na naše diskusné fórum.